水利河道整治乙级资质的申请周期可以根据不同的情况而有所不同。根据之前的信息，我们可以总结出以下几种情况下的申请周期：

一般情况下：
通常需要2到3个月左右的时间来完成审核。
特殊情况：
当涉及到从丙级资质升级到乙级资质时，整个过程可能需要从几个月到一年不等的时间，具体取决于企业自身的准备情况、政府审批部门的工作进度、是否需要补充或修正材料以及现场核查的安排与结果反馈时间等因素。
简化流程：
有些情况下，申请周期可以缩短至60天左右，但这通常是在所有申请材料齐全且符合要求的情况下实现的。
复杂情况：
对于某些特定情况，比如直接申请乙级资质而不是从较低级别升级的情况，周期可能会较长，一般在十个月左右。

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