资质申请被驳回的主要原因可以归纳为以下几类：

1. **材料不齐全或不符合要求**：

  - 提交的材料缺少必要的证明文件，如营业执照、法人身份证、组织机构代码证等。

  - 材料格式不正确，例如图片模糊不清或非彩色件。

  - 内容不完整或信息有误。

2. **企业实力不足**：

  - 企业规模小，技术人员数量不够，技术水平不高，财务状况不佳等。

  - 注册建造师数量不达标，技术工人数量不足，净资产不符合标准等。

3. **人员配置问题**：

  - 没有足够的专业技术人员，包括注册建造师、工程师和技术人员。

  - 存在人员重复注册、项目经理超范围承担项目、技术负责人工作经历不足等问题。

  - 技术负责人职称不符合标准，未经审计或与实际情况不符。

4. **违法违规记录**：

  - 企业在申请资质升级或增项时存在违法违规行为或者重大安全质量事故的历史记录。

5. **审核标准与流程复杂**：

  - 资质审核的标准严格且流程复杂，不同资质类别的审核标准各异，并随政策变化不断调整。

  - 审核过程涉及多个环节，任一环节出现问题都可能导致失败。

6. **特定行业要求未满足**（以ICP许可证为例）：

  - 材料不齐全：如域名证书缺失、股东信息不清晰。

  - 网站内容违规：涉及未获前置审批的内容或含有违法信息。

  - 公司资质不符：外资比例超标、注册资金不足。

  - 信息安全措施不到位：缺乏完善的信息安全管理制度或服务器托管不符合要求。

  - 申请流程不规范：申请表填写错误或提交材料格式不正确。

针对上述原因，企业在准备资质申请前应确保所有需要提交的材料完整无误，符合最新的政策和标准要求，并仔细审查自身的综合实力是否达到相应的资质等级。此外，对于任何潜在的问题，应及时采取纠正措施，必要时可寻求专业的法律或咨询服务。