是的，申请单位是否有不良信用记录确实会影响审批结果。在申请工程设计乙级资质或其他相关资质时，主管部门会综合考量企业的整体情况，包括但不限于其技术能力、人员配置、设备条件和财务状况等。其中，企业的信用记录是一个重要的考量因素。

不良信用记录可能包括但不限于以下几种情况：

- **违反法律法规**：如企业曾因违法行为受到行政处罚。
- **欠缴税费**：未能按时足额缴纳应缴税款。
- **合同违约**：未按照合同约定履行义务，导致对方权益受损。
- **工程质量与安全问题**：因工程质量不合格或安全事故被相关部门通报批评或处罚。
- **拖欠工资或劳务费用**：对员工或劳务提供者存在恶意欠薪行为。

这些不良记录不仅反映了企业在商业活动中的诚信度，也间接体现了其管理水平和经营状态。因此，在资质审核过程中，如果发现申请单位有严重的不良信用记录，可能会被视为不符合资质要求，从而影响审批结果。相反，良好的信用记录有助于提升企业的信誉度，增加审批通过的可能性。

为了确保顺利通过资质审批，建议申请单位在提交申请前仔细检查自身的信用状况，并积极纠正任何存在的问题。此外，保持良好的商业信誉和遵守法律法规对于长期发展也是非常重要的。